O parasita é encontrado nas fezes de seres humanos, animais domésticos (especialmente gado) e animais silvestres infectados. A infecção ocorre após ingestão do parasita. Isto é chamado de transmissão fecal-oral. A transmissão fecal-oral pode ocorrer de pessoa a pessoa, de animal a animal, ou de animal a pessoa.
Criptosporidiose é uma infecção causada por Cryptosporidium. O sintoma principal é diarreia aquosa, na maioria das vezes com outros sinais de distúrbios GI. A doença é tipicamente autolimitada em pacientes imunocompetentes, mas pode ser persistente e grave naqueles com aids.
O diagnóstico da criptosporidiose é feito por meio da pesquisa de oocistos nas fezes através do exame parasitológico, ou por meio da pesquisa de oocistos em material de biópsia intestinal ou raspado de mucosa.
Ha autores que defendem que o Blastocystis hominis não causa infecção em imunocompetentes. Não ha consenso quanto a melhor forma de tratar: metronidazol; nitazoxanida; iodoquinol.
Entamoeba histolytica: é a ameba intestinal; protozoário causador da amebíase, terceira causa de morte por doença parasitária, sendo muito comum nos países tropicais. Esse protozoário, habitante do intestino grosso humano, pertence ao sub-filo Sarcodina, tendo forma amebóide e locomovendo-se através de pseudópodos.