É possível armazenar metano líquido na pressão de 1 atm se a temperatura for cerca de -160 graus C. O armazenamento e transporte de grandes quantiddes de GNV pode ser feito em tanques especiais, em baixa pressão (1 atm) e baixa temperatura (-160 graus C).
O biogás também pode ser armazenado em média pressão entre 2 e 200 psi. Para evitar a corrosão dos componentes do tanque e garantir uma operação segura, o biogás deve primeiro ser limpo removendo-se o H2S. Em seguida, o biogás limpo deve ser ligeiramente comprimido antes do armazenamento em tanques.
Há duas formas de se construir o filtro de impurezas. A primeira delas, em geral mais simples e barata, é forçar com que o biogás passe por uma camada de palha de aço. A esponja de aço em contato com o biogás enferruja, e assim, elimina os principais gases que geram o mau cheiro.
Para se fazer a purificação do biogás será necessário montar uma usina de purificação, a qual é constituída, basicamente, das seguintes unidades: